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減少實驗次數,不用DOE,用貝葉斯優化
時間:2026-02-02 14:28:11 來源:Integle鷹谷
摘要 : 本文對比傳統實驗設計(DOE)與貝葉斯優化在藥物研發等配方優化場景中的優劣,后者以更少實驗高效尋優,鷹谷InAI平臺大幅降低了其使用門檻。

在藥物研發、精細化工及新材料等配方優化場景中,“如何用最少的實驗次數找到最優解”始終是研發人員的核心訴求。長期以來,實驗設計(DOE)是行業的主流選擇,但隨著AI技術的發展,貝葉斯優化(Bayesian Optimization, BO)正以其更高的實驗效率和智能化體驗,成為研發數字化的新寵。

一、DOE:預設藍圖 vs 貝葉斯優化:邊走邊看

在優化實驗中,DOE和貝葉斯優化代表了兩種截然不同的思維方式:

DOE(實驗設計,Design of Experiment):傳統DOE(如全因子設計、正交設計、響應面法RSM)采用預先結構化的實驗方案,通過統計回歸模型(線性/二次)擬合因素與響應關系,分析主效應、交互效應,最終找到較優區域。優點:模型可解釋性強(p值、置信區間、主效應圖),流程標準化,易滿足GMP/GLP/NMPA/FDA等合規審計要求。缺點:實驗次數與因素數呈指數增長(k因素2水平全因子需2^k次),對高維(≥6因素)、強非線性/黑箱系統擬合能力有限,常需補點,總體實驗量較大。

貝葉斯優化(Bayesian Optimization,BO)BO基于概率代理模型(最常用高斯過程Gaussian Process)對未知目標函數建模,每完成一輪實驗后立即更新后驗分布,再通過采集函數(如EI、PI、UCB)智能選擇下一個最具信息增益的實驗點,在探索(未知區域)利用(已知較好區域)之間取得平衡,逐步逼近全局最優。優點:自適應迭代、無需預設實驗總數,在高維、非凸、非線性、黑箱場景下實驗次數通常遠少于DOE(常見節省30%–60%,極端可達90%)。特別適合配方優化中常見的痛點:多原料比例+多工藝參數(pH、溫度、時間、流速等)、響應復雜協同/拮抗、單次實驗耗時耗材。缺點:模型可解釋性較弱(更偏向“給出最優推薦+置信度”,而非清晰的效應分解),早期合規落地需額外驗證流程可追溯性。

二、貝葉斯優化是趨勢

前沿探索性研發,本質就是與“高維黑箱”博弈的過程。在絕大多數現代配方/工藝優化場景(尤其是生物制藥、抗體純化、新材料、食品配方等領域),貝葉斯優化更值得推薦,因為它直接解決“實驗最貴”的核心痛點——用最少實驗找到最優解。低維、強監管、需詳細機理分析時可仍選DOE,或采用DOE先篩關鍵因素 → BO精細優化的組合策略。這已成為工業界主流趨勢。


三、鷹谷InAI:讓貝葉斯優化像聊天一樣簡單

盡管優勢明顯,標準貝葉斯優化的應用門檻卻很高。科學家需要理解高斯過程、采集函數(如EI, UCB)、超參數調整等復雜概念,并借助Python編程或專業軟件進行操作,這讓許多實驗科學家望而卻步——聽過,但不會用,不敢用。

鷹谷信息(Integle)的科研AI大模型InAI,徹底顛覆了這一局面。 它將先進的貝葉斯優化引擎與自然語言對話能力深度融合,帶來了革命性的體驗:

特色(1):對話式交互,小白也能輕松上手

標準BO操作:如Python bayesian optimization、GPyOpt、BoTorch等,需要編寫代碼或配置復雜軟件界面、定義目標函數、變量范圍、選擇代理模型/采集函數、寫迭代循環、手動記錄每次實驗結果、自己判斷收斂。

鷹谷InAI BO操作:您只需要像與同事討論一樣,用自然語言描述您的優化目標。例如,直接輸入:“我想優化一個催化劑的合成配方,目標是產物收率最大化,相關因素有反應溫度(80-150℃)、壓力(1-5MPa)、催化劑用量(1-5mol%),目前已有3組歷史實驗數據。”AI會自動理解您的意圖,引導您確認優化目標和約束條件,并調用內置的貝葉斯優化引擎開始工作。無需任何數學和編程背景,就能用出專家水平。

特色(2):與研發數據流無縫集成
鷹谷InAI并非孤立工具,它植根于鷹谷SIMS科研智能管理平臺。這意味著:

數據自動獲取:優化可直接關聯InELN(電子實驗記錄本)中的歷史實驗數據或實時實驗結果。

知識增強:結合鷹谷自研的知識圖譜和DeepSeek大模型,AI的推薦不僅基于數學模型,還能融入公開文獻和專利中的化學、生物領域知識,使建議更具科學合理性。

閉環落地:優化推薦的實驗方案可直接生成ELN實驗記錄模板,完成后數據自動回傳,形成“設計-執行-學習-再優化”的智能閉環。

參考資料:

[1] 減少實驗次數!鷹谷貝葉斯優化智能體:小白都能用,告別學了就忘. 

https://mp.weixin.qq.com/s/v3qrM5GFxJF_zr298bYEVA

[2] . 鷹谷貝葉斯優化接入DeepSeek,小白都能用!

https://mp.weixin.qq.com/s/wtZ0NNHDlWWPIwzTo2OPFg

[3] 盤點:藥物研發中最好用的16款電子實驗記錄本ELN.

https://mp.weixin.qq.com/s/5g6p7rFRSpMLHJZtfdVl5A

[4] 國家藥監局藥審中心關于發布《藥物臨床試驗中應用貝葉斯外部信息借用方法的指導原則(試行)》的通告(2026年第6號). NMPA CDE. 2026.1.22.

https://www.cde.org.cn/main/news/viewInfoCommon/1b87c172f248c6eb876ea2b9d93c4d1e

[5] 從實驗室到病床,貝葉斯方法打通最后一公里,患者還要等多久?

https://www.sohu.com/a/976920426_122575034

[6] FDA最新草案:監管松綁,醫藥開發或迎來“小樣本、快審批”時代_貝葉斯優化. 2026.

https://news.qq.com/rain/a/20260114A05YI300

[7] 誰是國內電子實驗記錄本老大?

https://mp.weixin.qq.com/s/ZRpo23nK8QhrsK_-JbKxEA

[8] 《CIAPH2024-2025年度醫藥健康行業數字化調研報告》.

http://www.ileader.com.cn/html/2025/3/3/72409.htm

[9]《CIAPH2023-2024年度醫藥健康行業數字化調研報告》.

http://www.ileader.com.cn/html/2024/2/2/72345.htm

[10] Kruschke, J. K. & Liddell, T. M. Bayesian data analysis for newcomers. Psychon. Bull. Rev. 25, 155–177 (2017).

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[11] Eric Brochu. Interactive Bayesian optimization : learning user preferences for graphics and animation. University of British Columbia Library.PhD Thesis/Dissertation. 2011.

https://open.library.ubc.ca/soa/cIRcle/collections/ubctheses/24/items/1.0051462

[12] Johannes P. Durholt and et al. BoFire: Bayesian Optimization Framework Intended for Real Experiments. J.Mac. Lea. Res. 26 (2025) 1-7.

https://jmlr.org/papers/volume26/24-1540/24-1540.pdf

[13] Ma Y and et al. Preference-Aware Bayesian Optimization for Interactive Decision Making. IEEE Trans Cybern. 2025.

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https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41563327/

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https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41504386/

[17] Fumina A and et al. Bayesian Optimization of Colloidal Monolayer Formation in Langmuir-Blodgett System. Langmuir. 2025.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41059978/

[18] Zhuo H and et al. Gaussian Process-Based Multi-Fidelity Bayesian Optimization for Optimal Calibration Point Selection. Sensors (Basel). 2025.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41305237/

[19] Stephen J. Ruberg et al. Application of Bayesian approaches in drug development: starting a virtuous cycle | Nature Reviews Drug Discovery. 2023.

https://www.nature.com/articles/s41573-023-00638-0

[20] FDA Issues Guidance on Modernizing Statistical Methods for Clinical Trials. 2026.1.12.

https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-issues-guidance-modernizing-statistical-methods-clinical-trials

[21] Use of Bayesian Methodology in Clinical Trials of Drug and Biological Products. FDA. 2026.1.12

https://www.fda.gov/regulatory-information/search-fda-guidance-documents/use-bayesian-methodology-clinical-trials-drug-and-biological-products

[22] Asif Khan and et al. Toward real-world automated antibody design with combinatorial Bayesian optimization. Cell Reports Methods,Volume 3, Issue 1,2023.

https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100374.

[23] Introduction to Bayesian optimization.

https://livebook.manning.com/book/bayesian-optimization-in-action/chapter-1

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